Les protéines assurent de nombreuses fonctions biologiques et sont constamment en mouvement, changeant rapidement de conformation moléculaire pour effectuer des tâches spécifiques dans les divers processus biologiques à l’intérieur de la cellule. À l’échelle moléculaire, l’eau est un rouage essentiel de la stabilité, de la structure, du mouvement et de la fonction des protéines. Les protéines et les molécules qui les ciblent par leur action pharmacologique existent en milieu aqueux.
ReSOLVEMC est la seule plateforme technologique qui permet de modéliser toutes les conformations d’une protéine, d’identifier les sites de liaison exploitables sur le plan pharmacologique, de se représenter de façon précise l’environnement dynamique formé par les molécules d’eau d’une cavité protéique et d’utiliser cet environnement de solvatation pour générer une sorte de moule virtuel à petites molécules, que nous avons appelé « hydrocophoreMD ».
ReSOLVEMC intègre l’hydrocophoreMD dans ses calculs pour orienter le criblage virtuel et proposer des composés potentiellement actifs. Une fois les résultats validés in vitro en laboratoire, les composés effectivement actifs permettent de focaliser davantage le criblage et d’opérer une optimisation chimique, comme en témoigne notre programme d’inhibiteurs de cGAS. Grâce à ReSOLVEMC, nous sommes en mesure d’identifier de nouvelles molécules contre des cibles jusqu’ici inaccessibles à l’inhibition par de petites molécules, et d’optimiser rapidement ces molécules vers un candidat au développement.
